常見問題
目前,主要可以通過以下幾種方法來檢驗基因組組裝的準確性。
?、?通過構建BAC或Fosmid文庫,并進行常規測序,將所得序列與拼接好的Contigs做比對以判斷基因組組裝的準確率。
?、?將已知的基因序列與拼接好的Scaffolds做比對,查看兩者是否吻合,吻合度越高,表明基因組組裝越好。而且已知的基因序列越多,評價結果越可靠。
?、?估計組裝后基因組的單堿基準確度,利用新一代測序技術,如果95%以上的基因組單堿基覆蓋度超過20×,則認為該基因組的單堿基準確度較高。
今天是2022年3月18日 星期五,歡迎光臨本站 安徽同致生物工程股份有限公司 網址: www.hsylzb.com
目前,主要可以通過以下幾種方法來檢驗基因組組裝的準確性。
?、?通過構建BAC或Fosmid文庫,并進行常規測序,將所得序列與拼接好的Contigs做比對以判斷基因組組裝的準確率。
?、?將已知的基因序列與拼接好的Scaffolds做比對,查看兩者是否吻合,吻合度越高,表明基因組組裝越好。而且已知的基因序列越多,評價結果越可靠。
?、?估計組裝后基因組的單堿基準確度,利用新一代測序技術,如果95%以上的基因組單堿基覆蓋度超過20×,則認為該基因組的單堿基準確度較高。
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