常見問題
目前研究轉錄組主要有三種方法,包括基于Sanger測序法的SAGE (serial analysis of gene expression)、LongSAGE和MPSS(massively parallel signature sequencing),基于雜交技術的cDNA芯片和寡聚核苷酸芯片,基于高通量測序技術的轉錄組測序與另兩種方法相比,轉錄組測序具有以下優勢: ① 高靈敏度,檢測閾值跨越6個數量級,能檢測到細胞中幾乎所有的轉錄本,包括一些只有幾個拷貝的稀有轉錄本,同時能對轉錄本進行定量; ② 高準確率,能準確的測定每個轉錄本的單核苷酸,同時不存在生物芯片的熒光模擬信號帶來的交叉反應和背景噪音的問題; ③ 應用范圍廣,無需預先設計探針或了解物種的基因信息,即可對任意物種進行轉錄組測序,同時能發現新的轉錄本,預測新的基因,檢測可變剪切、SNPs、融合基因等。
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